近日，我校第二醫(yī)院薛金梅團(tuán)隊(duì)依托山西醫(yī)科大學(xué)-華大未來醫(yī)學(xué)聯(lián)合研究中心，與華大生命科學(xué)研究院劉傳宇團(tuán)隊(duì)合作，在《STAR Protocols》上聯(lián)合發(fā)表了一篇題為“Protocol for optimized nasal mucosa sample processing to obtain high-quality scRNA-seq and scATAC-seq data”的論文。薛金梅教授、華大生命科學(xué)研究院的劉傳宇副研究員和殷建華副研究員為論文的共同通訊作者。我校學(xué)生武毅莎、韓世鍇，與香港中文大學(xué)學(xué)生黃亞靈，以及西南大學(xué)學(xué)生王巧玲為論文的共同第一作者。
鼻黏膜作為呼吸道的重要屏障，承擔(dān)著嗅覺、空氣過濾和調(diào)節(jié)，以及宿主防御等多重功能。鼻黏膜組織中高度多樣的細(xì)胞類型為實(shí)現(xiàn)這些復(fù)雜的生理功能提供了基礎(chǔ)，但這些細(xì)胞類型在健康和疾病狀態(tài)下的分子特征尚未得到完全解析。因此，利用高通量單細(xì)胞測序技術(shù)深入分析鼻黏膜樣本的細(xì)胞功能狀態(tài)，對于研究人員更好地理解鼻腔疾病的病理機(jī)制，推動診斷和治療方法的進(jìn)步具有重要意義。然而，如何同時(shí)獲得高質(zhì)量的鼻黏膜樣本單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)（scRNA-seq）和表觀基因組學(xué)（scATAC-seq）數(shù)據(jù)，一直是研究人員面臨的重大挑戰(zhàn)。
該研究提出了一種優(yōu)化的鼻黏膜樣本處理方案，詳細(xì)描述了從人類鼻黏膜組織中提取樣本的步驟，包括機(jī)械和酶解離、紅細(xì)胞裂解以及活性測定。研究團(tuán)隊(duì)還介紹了文庫制備和質(zhì)量控制的具體流程。這一成果的發(fā)表，將為鼻黏膜組織的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)和表觀基因組學(xué)研究提供高質(zhì)量的數(shù)據(jù)支持，有望為鼻腔疾病的深入研究提供重要的技術(shù)支持，推動相關(guān)領(lǐng)域的科學(xué)研究和臨床應(yīng)用的發(fā)展。
本研究得到了山西醫(yī)科大學(xué)-華大未來醫(yī)學(xué)聯(lián)合研究中心和深圳市單細(xì)胞組學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室的支持。
（圖文/董瑞）
