近日,我校崔永萍教授領(lǐng)軍的科研團隊關(guān)于食管癌的最新研究成果在Nature系列期刊Nature Communications(IF 12.353)發(fā)表題為“Multi-region sequencing unveils novel actionable targets and spatial heterogeneity in esophageal squamous cell carcinoma”的原創(chuàng)文章,揭示了來自同一食管鱗癌患者不同區(qū)域的樣本中藥物靶標(biāo)或生物標(biāo)記物的高度異質(zhì)性,突出了多區(qū)域測序?qū)τ诰_治療的必要性。
研究人員對來自39例腫瘤樣本的185個腫瘤區(qū)域和39個匹配的正常樣本進行了測序分析,平均測序深度分別達(dá)到290×和187×。共檢測到11,703個非沉默單核苷酸變異和961個插入缺失變異,每個樣本中位數(shù)為189個非沉默變異和14個插入缺失,突變數(shù)量在個體中差異很大。具有較大腫瘤體積的食管鱗癌個體的突變負(fù)荷高于具有較小腫瘤的個體。同時發(fā)現(xiàn)通過多區(qū)域測序鑒定的個體的突變顯著高于單區(qū)域分析或來自癌癥基因組圖譜(TCGA)突變數(shù)據(jù)的突變。此外還發(fā)現(xiàn)有12.8%的ERBB4突變,并且功能實驗證明了它的致癌作用;敲低BRCA1/2的表達(dá),顯著增加了食管鱗癌細(xì)胞對鉑類藥物的敏感性;5%的個體攜帶CD274的局部高水平擴增,導(dǎo)致PDL1的大量表達(dá),這類個體可能對免疫檢查點阻斷更敏感。該研究揭示了食管鱗癌中的高度異質(zhì)性,確定了ERBB4、BRCA1/2和PD-L1這幾個潛在的治療靶點,并可能為食管鱗癌治療提供新的策略。
本研究為我校牽頭的全國多中心研究項目,項目的開展得到了北京大學(xué)香港科技大學(xué)醫(yī)學(xué)中心、中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院分子腫瘤國家重點實驗室、北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部腫瘤醫(yī)院、山西省腫瘤醫(yī)院的合作支持。同時也得到了國家科技部重點研發(fā)項目、國家自然科學(xué)基金重點項目、面上項目和青年項目等多個國家級項目的科研基金資助。
文章鏈接:https://www.nature.com/articles/s41467-019-09255-1。