我校與合作者在肝細胞癌標志物及治療靶點方面取得進展
肝細胞癌(HCC)的早期診斷和靶向治療是提高HCC患者治愈率和生存率的主要途徑。研究發(fā)現(xiàn)CircRNAs或是一種頗具潛力的腫瘤診斷生物標記物和治療靶標。2019.2.4山西醫(yī)科大學2016級微生物專業(yè)碩士研究生雷波等在CancerMedicine發(fā)表題為Circular RNA expression profiles of peripheral blood mononuclear cells in hepatocellular carcinoma patients by sequence analysis的研究論文。論文通過RNA-seq揭示了一種circRNA(circ_0000798)可作為HCC早期篩查標志物和治療的新靶點。該文由山西醫(yī)科大學與陸軍軍醫(yī)大學合作完成,山西醫(yī)科大學為第一產(chǎn)權(quán)單位。
本研究首先通過高通量RNA-seq技術(shù),深度分析HCC特異差異表達的候選RNA分子,經(jīng)擴大樣本RT-PCR驗證篩選出HCC特異高表達的circ_0000798。經(jīng)Sanger測序驗證及統(tǒng)計分析證明circ_0000798與HCC肝硬化,腫瘤大小等顯著正相關(guān),與患者生存時間顯著負相關(guān),ROC曲線表明該分子可作為HCC早期診斷的標記物(相關(guān)成果已申請發(fā)明專利,實質(zhì)審查階段)。
此外,該研究經(jīng)生物信息學多維度分析表明circ_0000798可海綿多個HCC特異的miRNA分子,調(diào)控免疫效應(yīng)分子IFNG,TNFAIP和ICAM1以及免疫調(diào)節(jié)分子FOS,BCL家族和SGK1等,解讀了circ_0000798對HCC病理的免疫調(diào)控作用,為后續(xù)靶向circ_0000798治療HCC奠定了基礎(chǔ)。
RNA-seq展示差異火山圖和熱圖
qRT-PCR及Sanger測序驗證結(jié)果
預后及ROC曲線展示