基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院解軍團(tuán)隊(duì)揭示共同參與神經(jīng)管畸形和神經(jīng)外胚層來源腫瘤發(fā)生的基因及潛在機(jī)制
神經(jīng)管畸形(Neural tube defects,NTDs)是胚胎發(fā)育過程中,神經(jīng)管閉合發(fā)生障礙而引起的一種常見的先天性出生缺陷疾病。在絕大多數(shù)脊椎動(dòng)物中,中空的神經(jīng)管是由神經(jīng)外胚層細(xì)胞增殖、內(nèi)陷并最終離開外胚層表面而形成。在人類的各類腫瘤組織中,有一類腫瘤同樣也是來源于早期胚胎的神經(jīng)外胚層,包括6種:原始神經(jīng)外胚層瘤(Primitive Neurotodermal Tumour)、神經(jīng)膠質(zhì)瘤(Glioma)、膠質(zhì)母細(xì)胞瘤(Glioblastoma)、成神經(jīng)細(xì)胞瘤(Neuroblastoma)、神經(jīng)鞘瘤(Neurilemmoma)和髓母細(xì)胞瘤(Medulloblastoma)。其中,膠質(zhì)母細(xì)胞瘤(GBM)是較常見且致死率極高的腦部腫瘤。
研究基于RA誘導(dǎo)的NTDs鼠胚RNA-seq高通量測(cè)序數(shù)據(jù)及小RNA測(cè)序數(shù)據(jù)、人NTDs樣本芯片表達(dá)譜數(shù)據(jù)、GEPIA數(shù)據(jù)庫GBM腫瘤測(cè)序數(shù)據(jù)及DisGeNET等其他公共數(shù)據(jù)庫的開放數(shù)據(jù)開展研究。挖掘和鑒定了NTDs發(fā)生過程中、GBM腫瘤發(fā)生發(fā)展過程中的差異基因,對(duì)部分篩查獲得的“失控表達(dá)”基因分別在miRNA水平和蛋白水平進(jìn)行了驗(yàn)證。篩選到了2個(gè)在NTDs及GBM腫瘤中共享的表達(dá)趨勢(shì)一致的失控基因,并預(yù)測(cè)了可能與其靶向結(jié)合小分子藥物及其對(duì)接位點(diǎn)。篩選出了4個(gè)在NTDs及神經(jīng)外胚層來源腫瘤中共享的基因,并探索了這些基因可能存在的分子機(jī)制,為胚胎早期發(fā)育和腫瘤發(fā)生發(fā)展的關(guān)系研究提供新的思路。
與FGF1基因靶向結(jié)合的小分子藥物結(jié)合示意圖
部分研究結(jié)果近日以“Analysis of genes associated with both neural tube defects and neuroectodermal tumors”為題發(fā)表于Medical Science Monitor上。山西醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院博士生曹睿為第一作者,基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院劉志貞教授、趙虹副教授、解軍教授為共同通訊作者。