第五臨床醫(yī)學院李榮山課題組進行糖尿病腎病易感基因篩查及與腸道菌群關(guān)系的研究
糖尿病腎病(DN)做為糖尿病的一種主要微血管并發(fā)癥,發(fā)病率逐年升高,嚴重影響了我國人民的健康水平和社會經(jīng)濟的發(fā)展,但目前對其潛在分子致病機制的認識有限。人體胃腸道中有約100萬億種不同的微生物,DN患者中腸道微生物的變化以及微生物與宿主遺傳學之間的關(guān)系目前仍不清楚。因而,本研究采用全基因組關(guān)聯(lián)研究的方法,從遺傳學角度探討DN的易感基因,研究DN腸道菌群失衡模式以及遺傳變異對腸道菌群的影響,有利于深入探討DN的發(fā)病機制,構(gòu)建風險預測模型,進行精準診斷和治療。
我們納入了經(jīng)腎穿刺活檢證實的糖尿病腎病患者及糖尿病病程10年以上而無微血管病變的糖尿病患者進行GWAS研究(圖1),并在新的隊列中對結(jié)果進行了驗證,通過兩階段的GWAS研究確定了新的DN易感位點。此外,在我們的研究隊列中對先前報道的與DN有關(guān)的SNP位點進行了檢驗。
圖1曼哈頓圖和分位數(shù)-分位數(shù)(Q-Q)圖
此外,我們從微生物學的角度,通過對糖尿病腎病腸道菌群失衡模式分析,找出糖尿病腎病的關(guān)鍵菌群,建立分類算法模型,通過腸道菌群將糖尿病腎病患者與糖尿病患者及健康人群準確區(qū)分(圖2),并進一步探討腸道菌群與臨床表型及病理指標的相關(guān)性。
圖2三組腸道菌群分類模型
腸道菌群與多種腎臟疾病密切相關(guān),由于微生物組成是可遺傳的,我們假設(shè)控制腸道微生物組成的遺傳變異與DN易感性或臨床表型相關(guān)。從全基因組關(guān)聯(lián)研究數(shù)據(jù)庫中檢索與腸道微生物相關(guān)的遺傳變異,并在我們DN易感基因篩查的隊列中進行檢驗,利用微生物數(shù)量性狀基因座注釋,找到可能存在遺傳關(guān)聯(lián)的候選微生物,最后我們使用16S rDNA基因測序?qū)蜻x微生物進行驗證。
該工作是在山西醫(yī)科大學第五臨床醫(yī)學院李榮山教授的指導下完成的,第一作者為博士生路曉,該工作得到山西省腎臟病重點實驗室人員及136興醫(yī)工程重點科室山西省人民醫(yī)院腎內(nèi)科的眾多醫(yī)護人員的支持。