山西醫(yī)科大學(xué)附屬山西省眼科醫(yī)院孫斌教授課題組開展基于高通量測序技術(shù)及培養(yǎng)組學(xué)的眼鼻咽部微生物菌群研究取得新進展
由于眼部、鼻部及口咽部在解剖學(xué)上相通，故比較中國人群健康和疾病狀態(tài)下眼、前鼻孔和口咽的微生物群落，揭示不同人群眼鼻咽部微生物菌群的生物學(xué)信息。
高通量測序結(jié)果顯示健康人眼部和鼻部的微生物群落組成相似，與口咽部不同。本研究通過高通量測序技術(shù)共獲得38個門，94個綱，215個目，386個科，744個屬。培養(yǎng)組學(xué)及分離株基因組研究結(jié)果顯示,眼鼻咽部分離培養(yǎng)獲得的26個菌屬和55個菌種中，眼部和鼻部表皮葡萄球菌分離率最高，口咽部唾液鏈球菌分離率最高。ANI和Blast比較發(fā)現(xiàn)溶血性葡萄球菌、金黃色葡萄球菌及表皮葡萄球菌在眼鼻咽三個部位基因組相似性高。
圖1健康人眼鼻咽部微生物菌群Beta多樣性（PCA）：屬水平
研究表明，高通量測序技術(shù)、培養(yǎng)組學(xué)和單菌株全基因組測序方法相結(jié)合，可較為完整地提供眼鼻咽部微生物群落“屬”、“種”水平分類學(xué)特征。建立重點菌種的培養(yǎng)、鑒定和全基因組信息比較技術(shù)體系，可實現(xiàn)眼部及鄰近部位菌種的精準(zhǔn)溯源。為今后探討眼鼻咽部感染性疾病的發(fā)病機制、預(yù)防和新型微生態(tài)治療提供參考。
