三類(lèi)外周T細(xì)胞淋巴瘤基因突變譜的特點(diǎn)及臨床意義
T細(xì)胞淋巴瘤可以是惰性的或侵襲性的，占所有NHL的12%。由于NK細(xì)胞與T細(xì)胞密切相關(guān)，它們的惡性腫瘤也包括在該分類(lèi)中。PTCL的起源是來(lái)自胸腺后的成熟T細(xì)胞或NK/T細(xì)胞，是一組非霍奇金淋巴瘤（NHL），具有高度異質(zhì)性的形態(tài)學(xué)變化。根據(jù)2020年修訂的WHO淋巴瘤分類(lèi)，成熟T和NK細(xì)胞淋巴瘤和淋巴增生性疾病的分類(lèi)超過(guò)27種亞型[1]。PTCL主要包括8個(gè)亞型，包括PTL.NOS、AITL、ALK+ ALCL、ALK-ALCL、腸病相關(guān)T細(xì)胞淋巴瘤（EATL）、單形上皮性腸T細(xì)胞淋巴瘤（MEITL，也稱(chēng)為EATL-II型）、具有TFH表型的外周T細(xì)胞淋巴瘤（PTCL-TFH）和濾泡T細(xì)胞淋巴瘤（FTCL）。
NHL也可分為惰性或侵襲性疾病。惰性淋巴瘤的特點(diǎn)是病程長(zhǎng)，一般對(duì)標(biāo)準(zhǔn)化療有抵抗力，而侵襲性疾病通常有急性表現(xiàn)，有B型癥狀，病情發(fā)展迅速。皮膚T細(xì)胞淋巴瘤（CTCL）被認(rèn)為是惰性的，而包括其余的PTCL則被認(rèn)為是侵襲性的。三分之二的CTCL是由放線菌?。∕F）和塞扎里綜合征（SS）組成。PTL.NOS是PTCL中最常見(jiàn)的，其次是ALCL和AITL。
根據(jù)NCCN腫瘤學(xué)臨床實(shí)踐指南，2020版T細(xì)胞淋巴瘤中。大約30-50%的T細(xì)胞淋巴瘤沒(méi)有進(jìn)一步分類(lèi)，被稱(chēng)為PTL.NOS。在中國(guó)所有的NHL病例中，大約25-30%是PTCLs，明顯高于歐美國(guó)家（10-15%）。目前，一線治療仍然是CHOP（環(huán)磷酰胺+多柔比星+長(zhǎng)春新堿+潑尼松龍）或類(lèi)似CHOP的方案（CHOEP）。然而，除了ALK+ ALCL外，大多數(shù)PTCL都是高度惡性的。惡性程度高，病程兇險(xiǎn)，臨床效果差，一線治療后緩解率低，復(fù)發(fā)頻繁。
表觀遺傳學(xué)是指基因表達(dá)的變化在不改變DNA序列的情況下發(fā)生的現(xiàn)象。發(fā)生而不改變DNA序列的現(xiàn)象，并且細(xì)胞調(diào)節(jié)的一些表觀遺傳學(xué)機(jī)制包括組蛋白修飾、DNA甲基化、非編碼RNA的影響，以及染色質(zhì)重組。異常的HDACs(組蛋白脫乙酰酶)的活動(dòng)經(jīng)常影響基因表達(dá)，導(dǎo)致腫瘤抑制基因的表觀遺傳學(xué)沉默和致癌基因的激活。在PTCL中已經(jīng)觀察到特別是RHOA基因(Ras同源家族成員A) G17V、異檸檬酸脫氫酶(IDH2)和Ten-Eleven易位-2(TET2)突變更有可能導(dǎo)致亞型表現(xiàn)為T(mén)-濾泡型輔助表型，如AITL和PTL.NOS等。組蛋白修飾基因的突變與PTCL的疾病進(jìn)展有關(guān)。使T淋巴瘤細(xì)胞對(duì)表觀遺傳藥物敏感。在AITL和PTL.NOS之間存在一些突變基因的相似性，如TET2和腫瘤抑制因子DNA甲基轉(zhuǎn)移酶3A (DNMT3A)在原始干細(xì)胞中存在異常。
在最近修訂的2017年WHO分類(lèi)中，被定義為nPTCL-TTFH并被納入的一種亞型，即 "AITL和其他TFH細(xì)胞來(lái)源的T細(xì)胞淋巴瘤"。該類(lèi)別中的腫瘤細(xì)胞，包括AITL、nPTCL-TFH、NPTCL-TFH和AITL-TFH，都是TFH細(xì)胞來(lái)源的腫瘤。這一類(lèi)的腫瘤細(xì)胞包括AITL、nPTCL-TFH和濾泡T細(xì)胞淋巴瘤(FTCL)，必須至少表達(dá)以下兩項(xiàng)（最好是三項(xiàng)）： 基于IHC的TFH標(biāo)志物：CD10、BCL6轉(zhuǎn)錄抑制器（BCL6）、程序性細(xì)胞死亡1（PDCD1/CD279/PD-1），C-X-C動(dòng)點(diǎn)趨化因子配體13（CXCL13），趨化因子受體5（CXCR5），誘導(dǎo)性T細(xì)胞成本刺激（ICOS）以及信號(hào)淋巴細(xì)胞活化分子相關(guān)的蛋白（SAP）。
根據(jù)GEPs將PTL.NOS進(jìn)一步分類(lèi)如下：PTL. NOS具有1型輔助T細(xì)胞（Th1）特征，表達(dá)T-bet（TBX21）和其靶點(diǎn)為PTCL-TBX21（49%的PTL.NOS）；PTL.NOS具有Th2特征并表達(dá)GATA結(jié)合蛋白3（GATA3）及其靶點(diǎn)的PTCL-GATA3（33%）；以及PTL.NOS兩者均無(wú)特征，為 "無(wú)法分類(lèi)"（18%）。PTCL-GATA3亞組的患者預(yù)后比PTCL-TBX21亞組中的患者差。Wang等研究GATA3的表達(dá)區(qū)分了具有不同分子特征的PTL.NOS亞組。Lone W [39]等報(bào)道，GATA3的表達(dá)區(qū)分了一個(gè)PTL.NOS亞組，具有明顯的分子特征，Th2特征和不良預(yù)后。PTCL-GATA3亞組的激進(jìn)的臨床過(guò)程可能是由于致癌途徑的高活性和相對(duì)于PTCL-TBX21而言，該組患者的基因組異常情況更為復(fù)雜。與PTCL-TBX21相比，該組的基因組異常更為復(fù)雜。
ALCL是一組CD30+成熟T細(xì)胞淋巴瘤，具有相同的形態(tài)學(xué)和免疫表型特征，但在臨床和遺傳特征上表現(xiàn)出異質(zhì)性。目前，各種類(lèi)型的間變性大細(xì)胞淋巴瘤約占全世界PTCL的15%[40]。根據(jù)世界衛(wèi)生組織的造血和淋巴組織腫瘤分類(lèi)，ALCL有四種亞型:ALK+ALCL)、ALK?ALCL)、原發(fā)性皮膚ALCL (pcALCL)和乳房植入物相關(guān)ALCL (BIA-ALCL)。分子遺傳學(xué)表現(xiàn)也為多種，如：大多數(shù)病例(約80%)顯示染色體易位t(2;5)，導(dǎo)致2p23位點(diǎn)的ALK基因與5q35位點(diǎn)的核磷胺(NPM)基因融合。嵌合ALK融合蛋白的存在提示在這些淋巴瘤的進(jìn)展中起著至關(guān)重要的作用[41]?？偠灾?，13%的病例涉及原肌凝蛋白3 (TPM3: 1q25)， 1%的病例涉及IMP環(huán)水解酶/5氨基咪唑-4-羧酰胺核糖核苷酸甲酰轉(zhuǎn)移酶(ATIC: 2q35)， 1%的病例涉及trk融合基因(TFG: 3q12.2)。其他易位的發(fā)生率均低于1%，包括肌凝蛋白重鏈9 (MYH9: 22q11.2)、格網(wǎng)蛋白重鏈(CLTC: 17q23)、原肌凝蛋白4 (TPM4: 19p13.1)、moesin (MSN: Xq11-12)、無(wú)名指蛋白213 (RNF213: 17q25)。所有突變易位導(dǎo)致ALK -酪氨酸激酶激活，這是發(fā)生間變大細(xì)胞淋巴瘤的一個(gè)重要環(huán)節(jié)。
組成性活性的ALK融合蛋白通過(guò)磷酸化以及較多信號(hào)通路的激活誘導(dǎo)腫瘤發(fā)生。信號(hào)轉(zhuǎn)換器和轉(zhuǎn)錄激活因子3 (STAT3)的致癌活性是通過(guò)其對(duì)參與細(xì)胞周期、死亡、免疫系統(tǒng)、脈管系統(tǒng)和代謝的多種靶基因的控制介導(dǎo)的。STAT3通過(guò)模擬生理促生長(zhǎng)信號(hào)，如IL2和TCR信號(hào)通路，促進(jìn)腫瘤細(xì)胞增殖和存活，在ALCL的形成中發(fā)揮關(guān)鍵作用。最近的研究表明，干擾素調(diào)節(jié)因子4 (IRF4)是STAT3的關(guān)鍵靶基因，通過(guò)激活轉(zhuǎn)錄因子MYC促進(jìn)腫瘤細(xì)胞存活。然而，獨(dú)立于IRF4基因突變(易位或過(guò)表達(dá))，IRF4被證明可以誘導(dǎo)ALCL腫瘤細(xì)胞存活。這一過(guò)程被描述為骨髓瘤細(xì)胞中的一個(gè)自動(dòng)調(diào)節(jié)電路，IRF4直接靶向MYC，同時(shí)也作為MYC轉(zhuǎn)激活[45]的直接靶點(diǎn)。目前ALCL的治療CHOP是應(yīng)用最廣泛的治療方案。多項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn)，五年后的總生存率和無(wú)進(jìn)展生存率(PFS)分別超過(guò)70%和60%。在一項(xiàng)主要的分析中，德國(guó)高級(jí)別非霍奇金淋巴瘤研究組(Deutsche Studiengruppe hoch惡性非霍奇金淋巴瘤研究組)研究在CHOP中添加依托泊苷，通常以CHOEP的形式(依托泊苷，第1、2和3天100 mg/sqm)。
AITL、PTL.NOS和ALCL在PTCL中是較為常見(jiàn)的三種，這三類(lèi)均具有復(fù)雜的遺傳學(xué)改變，極具有異質(zhì)性，預(yù)后也不同，相比較而言，PTL.NOS預(yù)后最差，異質(zhì)性最強(qiáng)，表現(xiàn)在形態(tài)學(xué)方面也如此。AITL在形態(tài)學(xué)及免疫組織化學(xué)方面都有一定的特點(diǎn)，對(duì)應(yīng)的分子基因的突變也有一定的特點(diǎn)；ALCL形態(tài)學(xué)更有特點(diǎn)，典型的異常細(xì)胞及CD30的彌漫強(qiáng)表達(dá)就可以讓我們做出診斷，遺傳學(xué)上也有一些明確的分子遺傳學(xué)的改變；PTL.NOS形態(tài)學(xué)存在很多異質(zhì)性，沒(méi)有明確形態(tài)特點(diǎn)及免疫組織化學(xué)的表達(dá)，分子遺傳學(xué)目前也僅僅認(rèn)識(shí)到一部分，可能和不同的基因通路相關(guān)的分子改變，但研究此類(lèi)淋巴瘤還是難上加難，應(yīng)該應(yīng)用二代測(cè)序、蛋白芯片等高通量技術(shù)，來(lái)探究其分子遺傳學(xué)里更多的基因改變，從而可以更好地了解腫瘤發(fā)展的分子基礎(chǔ)，并為腫瘤的干預(yù)及治療尋找新的基因靶點(diǎn)。
利用1021個(gè)基因靶向測(cè)序，檢測(cè)了41例PTLC和4例反應(yīng)性淋巴的基因突變位點(diǎn)，其中1例ALCL未檢測(cè)出突變基因，其余病例中發(fā)現(xiàn)210個(gè)基因突變點(diǎn)，PTL.NOS16例中檢測(cè)到90個(gè)突變基因，AITL17例中檢測(cè)到95個(gè)突變基因，ALCL7例中檢測(cè)到25個(gè)突變基因，基因突變頻率較高的6個(gè)基因依次為：TET2、RHOA、DNMT3A、 致癌轉(zhuǎn)錄因子(TCF3)、小突觸前體細(xì)胞基質(zhì)蛋白(PCLO)、(F-Box和WD重復(fù)結(jié)構(gòu)域包含7)FBXW7。這些基因分別在三類(lèi)淋巴瘤中均有不同得突變率，如：TET2、DNMT3A、TCF3、FBXW7、PCLO?？赡芴崾救?lèi)T細(xì)胞淋巴瘤之間存在一定的交叉改變，在AITL中TET2表達(dá)率94%，RHOA82%，DNMT3A47%，IDH2 41%，TCF341%，PCLO24%，F(xiàn)BXW724%。在PTL.NOS中TET2表達(dá)率為38%，PCLO38%，F(xiàn)BXW7 38%、TP53 31%、TCF3C25%、DNMT3A25%、共濟(jì)失調(diào)毛細(xì)血管擴(kuò)張突變基因（ATM）19%。在ALCL中TCF3 43%、ERBB2受體酪氨酸激酶4 (ERBB4) 29%、PCLO29%、DNMT3A29%、TET2 29%、FBXW7 29%。（圖1）
圖1 全部病例基因突變?nèi)皥D
我們的課題組發(fā)現(xiàn)PTCL中GATA3陽(yáng)性組的VAF（一種新腫瘤標(biāo)記物）中位值高于陰性組，提示GATA3陽(yáng)性組與腫瘤負(fù)荷相關(guān)，而與檢測(cè)出了突變基因未發(fā)現(xiàn)有相關(guān)性，可能說(shuō)明GATA3/TBX21分組與PTCL不同于突變基因譜在疾病中發(fā)揮的作用。（圖2）
圖2 PTCL中GATA3/TBX21與VAF中位值的關(guān)系
另外總結(jié)三類(lèi)外周T細(xì)胞淋巴瘤中所有基因的突變比例和突變基因的種類(lèi)，發(fā)現(xiàn)在AITL和PTL.NOS 間存在共同的基因突變類(lèi)型如：TET2、DNMT3A、TCF3、PCLO及FBXW7。在AITL中RHOA和IDH2表達(dá)較特殊，僅在AITL中檢測(cè)到這兩種基因的突變，而且突變率較高，提示此種基因可能作為鑒別AITL和PTL.NOS的特點(diǎn)基因，在病理診斷中可以做為一種鑒別的手段，而且有關(guān)報(bào)道也提出了存在RHOA和IDH2突變時(shí)，對(duì)應(yīng)的AITL形態(tài)學(xué)上也極具特點(diǎn)，鏡下表現(xiàn)為大片異型透亮細(xì)胞，圍繞在增生的高內(nèi)皮靜脈周?chē)?，還會(huì)混雜一些免疫母細(xì)胞及漿細(xì)胞、組織細(xì)胞及嗜酸性粒細(xì)胞。這些改變都可能提示在基因改變的背景下PTCL會(huì)呈現(xiàn)出不同形態(tài)學(xué)的特點(diǎn)。ALCL發(fā)生TCF3基因突變較高，同時(shí)存在PCLO的突變，雖然比例不高，但可以提示與PTL.NOS的基因中也是存在交叉的。ALCL也是一類(lèi)極具形態(tài)學(xué)特點(diǎn)的淋巴瘤，推測(cè)是否是TCF3突變基因的引導(dǎo)下形態(tài)學(xué)才會(huì)出現(xiàn)奇異核、馬蹄核及腎形核等特點(diǎn)，周?chē)准?xì)胞浸潤(rùn)。同樣在PTL.NOS出現(xiàn)TCF3突變時(shí)總結(jié)其形態(tài)學(xué)特點(diǎn)，可能也會(huì)出現(xiàn)怪異核形及炎細(xì)胞浸潤(rùn)，在PTL.NOS沒(méi)有形態(tài)學(xué)特點(diǎn)的情況下，借助基因的改變可能也是一種有效診斷手段。
我們實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示基因突變數(shù)據(jù)與此類(lèi)文獻(xiàn)也非常接近，尤其在PTL.NOS和AITL中存在TET2可能提示在原始造血干細(xì)胞發(fā)生表觀遺傳相關(guān)的一些基因突變，如TET2、DNMT3A，DNMT3A是髓系淋巴瘤和T細(xì)胞淋巴瘤中最常發(fā)生突變的基因。DNMT3A突變包含幾個(gè)點(diǎn)突變，R882H、R882C突變是最常見(jiàn)的突變。最近的研究發(fā)現(xiàn)DNMT3A R882突變與復(fù)發(fā)、不完全緩解率和低平均生存時(shí)間相關(guān)，常在急性淋巴細(xì)胞白血病中存在突變。有報(bào)道表明，DNMT3A或其突變體的缺失會(huì)導(dǎo)致造血干細(xì)胞的異常增殖，轉(zhuǎn)化為對(duì)化療藥物有抗藥性的白血病前干細(xì)胞，并導(dǎo)致AML患者復(fù)發(fā)[52]。TET2和DNMT3A同時(shí)參與調(diào)控DNA甲基化，異常時(shí)導(dǎo)致DNA甲基化失調(diào)，發(fā)育成異常的T或B細(xì)胞，再經(jīng)過(guò)第二次基因突變后引起CD4陽(yáng)性的T細(xì)胞發(fā)生單克隆增殖，從而成為T(mén)細(xì)胞淋巴瘤。同時(shí)如果B細(xì)胞在接受微環(huán)境的影響及EBV病毒的感染也會(huì)發(fā)展成B細(xì)胞淋巴瘤。Bustelo XR等人認(rèn)為DNMT3A在CD8 +外周T細(xì)胞淋巴瘤中是一種單倍不足的腫瘤抑制因子。DNMT3A的表達(dá)降低與抑癌因子p53的下調(diào)有關(guān)，這也可能有助于CD8 + PTCL的發(fā)病機(jī)制。
TCF3功能異常時(shí)，可刺激B細(xì)胞受體信號(hào)，特別是通過(guò)激活PI3K激酶途徑來(lái)完成。多數(shù)異常表現(xiàn)在B細(xì)胞淋巴瘤中，AITL中B細(xì)胞分布較PTL.NOS多，而且存在異常，可能檢出較高的TCF3突變也和異常的B細(xì)胞較多有關(guān)[54]。我們的研究結(jié)果中TCF3突變主要集中在ALCL和AITL中，可能提示在這兩種T細(xì)胞淋巴瘤中存在PI3K激酶通路的異常及B細(xì)胞的異常作用。如在裸T細(xì)胞型ALCL中與B細(xì)胞淋巴瘤難以區(qū)分，可能就是在基因的異常方面出現(xiàn)了一些相似的改變，引起形態(tài)學(xué)上的混淆。
PCLO是脊椎動(dòng)物特有的基因，它編碼突觸前活動(dòng)區(qū)(介導(dǎo)神經(jīng)遞質(zhì)釋放的專(zhuān)門(mén)區(qū)域)的大量蛋白質(zhì)成分。10-12 Piccolo已被發(fā)現(xiàn)與突觸前f -肌動(dòng)蛋白相互作用并控制其組裝，這對(duì)調(diào)節(jié)突觸囊泡周期很重要，這表明它可能通過(guò)這種相互作用調(diào)節(jié)神經(jīng)遞質(zhì)釋放有趣的是，人類(lèi)PCLO的突變不僅導(dǎo)致突觸功能障礙，還導(dǎo)致大腦和小腦容量的損失，這表明嚴(yán)重的神經(jīng)元損失。突觸活性對(duì)于防止細(xì)胞凋亡至關(guān)重要，因此可以想象PCLO缺失導(dǎo)致的突觸退化會(huì)觸發(fā)神經(jīng)元中的凋亡信號(hào)。有研究表明PCLO可能在鈣感測(cè)中起作用。在包括DLBCL、PTCL等在內(nèi)的多種腫瘤中，通過(guò)全外顯子測(cè)序檢測(cè)到PCLO突變。在膠質(zhì)母細(xì)胞瘤間質(zhì)亞型中，PCLO突變已被證明與預(yù)后不良相關(guān)， 我們研究的結(jié)果顯示PCLO基因突變組預(yù)后相對(duì)較差，雖然目前其與PTCL預(yù)后的相關(guān)性尚未報(bào)道，但出現(xiàn)預(yù)后差的提示，可能也需要進(jìn)一步的探究工作，來(lái)解決其作用機(jī)制和對(duì)PTCL的作用。
在PTL.NOS中檢測(cè)到共濟(jì)失調(diào)毛細(xì)血管擴(kuò)張突變（ATM）基因的異常，而且ATM突變組的預(yù)后也是較差的，關(guān)于這個(gè)基因我們還需要進(jìn)一步研究。共濟(jì)失調(diào)毛細(xì)血管擴(kuò)張癥是常染色體的以進(jìn)展為主要特征的隱性疾病小腦性共濟(jì)失調(diào)，眼部毛細(xì)血管擴(kuò)張免疫缺陷[65]。這種疾病是由基因突變引起的共濟(jì)失調(diào)毛細(xì)血管擴(kuò)張突變(Atm)基因。ATM基因產(chǎn)物Atm是一種含有3050個(gè)氨基酸的蛋白激酶，屬于磷酸肌醇3激酶相關(guān)蛋白激酶超級(jí)家族。ATM主要位于細(xì)胞核中，盡管在與過(guò)氧化物酶體相關(guān)的細(xì)胞質(zhì)中也發(fā)現(xiàn)了ATM。ATM作為一種多功能蛋白激酶，通過(guò)調(diào)節(jié)多種底物的磷酸化，在細(xì)胞周期控制、DNA損傷與修復(fù)、細(xì)胞生存與死亡等方面發(fā)揮著至關(guān)重要的作用。當(dāng)這個(gè)基因發(fā)生異常時(shí)，細(xì)胞周期和DNA修復(fù)等功能失調(diào)，引起的腫瘤的發(fā)生發(fā)展。對(duì)于這個(gè)新認(rèn)識(shí)的基因我們還有待于進(jìn)一步研究，發(fā)現(xiàn)其在T細(xì)胞淋巴瘤中的作用及意義。
綜合對(duì)比分析三類(lèi)PTCL之間的基因突變的關(guān)系，發(fā)現(xiàn)TET2、IDH2及RHOA在AITL中顯著高突變。充分說(shuō)明這三個(gè)突變基因在AITL還是有一定的特征性改變，能夠鑒別AITL與其他T細(xì)胞淋巴瘤的同時(shí)，也在形態(tài)學(xué)上給予了一定的提示作用。這也提示在PTCL中的各種形態(tài)學(xué)的背景下隱藏著不同類(lèi)型基因的改變特點(diǎn)，我們應(yīng)該進(jìn)一步擴(kuò)大病例數(shù)據(jù)的基礎(chǔ)上，總結(jié)歸納出各類(lèi)淋巴瘤不同基因下形態(tài)學(xué)的特點(diǎn)。（圖3）
圖3 PTL.NOS、AITL和ALCL基因突變相關(guān)分析圖
研究發(fā)現(xiàn)的相關(guān)突變基因TET2、IDH2、RHOA、DNMT3A、TCF3、PCLO、ATM及FBXW7等，與最近的測(cè)序研究確定了TET2、RHOA、DNMT3A和IDH2的反復(fù)突變和相互作用較類(lèi)似，提出了以TET2為代表的表觀遺傳調(diào)控在解釋AITL多步驟、多譜系的腫瘤發(fā)生過(guò)程中發(fā)揮著越來(lái)越重要的作用，為AITL患者提供了新的研究方向和治療策略，推測(cè)TET2可能可以作為AITL今后治療的靶點(diǎn)。我們的研究分析發(fā)現(xiàn)TET2和RHOA突變組的PTCL預(yù)后較差，也能間接的指出其基因發(fā)生突變更易引起的腫瘤事件，所以提示我們應(yīng)該診斷這類(lèi)基因及相關(guān)分子機(jī)制通路尋找靶點(diǎn)，指導(dǎo)治療。
目前研究發(fā)現(xiàn)TCF3、PCLO、ATM及FBXW7在腫瘤發(fā)生的機(jī)制中的具有重大作用，致癌轉(zhuǎn)錄因子（TCF3）功能異常時(shí)，可刺激B細(xì)胞受體信號(hào)，進(jìn)而發(fā)生B細(xì)胞淋巴瘤。FBXW7影響細(xì)胞存活、細(xì)胞增殖、腫瘤侵襲、DNA損傷修復(fù)、基因組不穩(wěn)定性和端粒生物學(xué)等許多調(diào)控功能。ATM作為一種多功能蛋白激酶，通過(guò)調(diào)節(jié)多種底物的磷酸化，在細(xì)胞周期控制、DNA損傷與修復(fù)、細(xì)胞生存與死亡等方面發(fā)揮著至關(guān)重要的作用。有研究表明PCLO在鈣感測(cè)中起作用，在包括DLBCL、外周T細(xì)胞淋巴瘤等在內(nèi)的多種腫瘤中，通過(guò)全外顯子測(cè)序檢測(cè)到PCLO突變，在膠質(zhì)母細(xì)胞瘤間質(zhì)亞型中，PCLO突變已被證明與預(yù)后不良相關(guān)。它們的突變?cè)诹馨土龅念A(yù)后意義中可能也有一定的提示作用，我們研究預(yù)后分析結(jié)果顯示PCLO突變組和ATM突變組預(yù)后較差的，也許能說(shuō)明它們可能是獨(dú)立的預(yù)后因素，進(jìn)而在分子機(jī)制通路方面可能也有所提示，為今后T細(xì)胞淋巴瘤診療與評(píng)估預(yù)后尋找靶點(diǎn)。（圖4-5）
圖4 ATM與PTCL預(yù)后的相關(guān)性分析圖
圖5 PCLO與PTCL預(yù)后的相關(guān)性分析圖
VAF是基因組中特定位置突變分子數(shù)量占野生型分子總數(shù)的比例，與臨床特征和預(yù)后密切相關(guān)，被認(rèn)為是一種新的腫瘤負(fù)荷生物標(biāo)志物。Fu等人發(fā)現(xiàn)TP53 . y88c和LATS2 . f972l的VAF在B細(xì)胞淋巴瘤合并CR患者中降低。非DNMT3A克隆的中位VAF從自體干細(xì)胞移植(ASCT)時(shí)的1%增加到診斷治療相關(guān)髓系腫瘤(tMNs)時(shí)的37%。我們研究發(fā)現(xiàn)，骨髓
受累的患者，VAF最大值和中位值均升高。此外，我們觀察到最大值VAF患者與中位值VAF患者，OS和PFS較差。（圖6-7）
圖6 PTCL在VAF中位數(shù)值下的生存分析圖
圖7 PTCL在VAF最大值下的生存分析圖
綜上總結(jié)，本研究通過(guò)對(duì)高通量測(cè)序發(fā)現(xiàn)三類(lèi)PTCL的基因突變譜，在三類(lèi)T細(xì)胞淋巴瘤之間存在共同的基因，同時(shí)也各自發(fā)現(xiàn)了每類(lèi)中相對(duì)獨(dú)有的一些基因，提示有些獨(dú)特的基因可以直接做為鑒別診斷哪類(lèi)T細(xì)胞淋巴瘤的一個(gè)依據(jù)，而且不同基因的突變可能出現(xiàn)形態(tài)學(xué)上特異性。今后我們將擴(kuò)大標(biāo)本量，在蛋白水平等方面驗(yàn)證這些基因在PTCL中的作用，從而為臨床治療和診斷及評(píng)估預(yù)后的理論依據(jù)。
參考文獻(xiàn)
[1] Rita Alaggio, Catalina Amador, Ioannis Anagnostopoulos, Ayoma D. Attygalle, Iguaracyra Barreto de Oliveira Araujo, Emilio Berti, Govind Bhagat, Anita Maria Borges, Daniel Boyer, Mariarita Calaminici, Amy Chadburn, John K. C. Chan, Wah Cheuk, Wee-Joo Chng, John K. Choi, Shih-Sung Chuang, Sarah E. Coupland, Magdalena Czader, Sandeep S. Dave, Daphne de Jong, Ming-Qing Du, Kojo S. Elenitoba-Johnson, Judith Ferry, Julia Geyer, Dita Gratzinger, Joan Guitart, Sumeet Gujral, Marian Harris, Christine J. Harrison, Sylvia Hartmann, Andreas Hochhaus, Patty M. Jansen, Kennosuke Karube, Werner Kempf, Joseph Khoury, Hiroshi Kimura, Wolfram Klapper, Alexandra E. Kovach, Shaji Kumar, Alexander J. Lazar,Stefano Lazzi, Lorenzo Leoncini, Nelson Leung, Vasiliki Leventaki, Xiao-Qiu Li, Megan S. Lim,Wei-Ping Liu, Abner Louissaint Jr, Andrea Marcogliese, L. Jeffrey Medeiros, Michael Michal,Roberto N. Miranda, Christina Mitteldorf, Santiago Montes-Moreno, William Morice, Valentina Nardi,Kikkeri N. Naresh, Yasodha Natkunam, Siok-Bian Ng, Ilske Oschlies, German Ott, Marie Parrens,Melissa Pulitzer, S. Vincent Rajkumar, Andrew C. Rawstron, Karen Rech, Andreas Rosenwald, Jonathan Said,Clémentine Sarkozy, Shahin Sayed, Caner Saygin, Anna Schuh, William Sewell, Reiner Siebert,Aliyah R. Sohani, Reuben Tooze, Alexandra Traverse-Glehen, Francisco Vega, Beatrice Vergier,Ashutosh D. Wechalekar, Brent Wood, Luc Xerri and Wenbin Xiao. The 5th edition of the World Health Organization Classification of Haematolymphoid Tumours: Lymphoid Neoplasms. Leukemia. 2022 Jul;36(7):1720-1748.
[2] Suheil Albert Atallah-Yunes, Michael J. Robertson, Utpal P. Davé. Epigenetic Aberrations and Targets in Peripheral T-Cell Lymphoma. Clin Lymphoma Myeloma Leuk. 2022 Sep;22(9):659-665.
[3] Stefano A Pileri, Valentina Tabanelli, Stefano Fiori, Angelica Calleri, Federica Melle, Giovanna Motta, Daniele Lorenzini, Corrado Tarella, Enrico Derenzini.Peripheral T-Cell Lymphoma, Not Otherwise Specified: Clinical Manifestations, Diagnosis, and Future Treatment. Cancers (Basel). 2021 Sep 9;13(18):4535.
[4] Shigeru Chiba, Mamiko Sakata-Yanagimoto, Advances in understanding of angioimmunoblastic T-cell lymphoma. Leukemia. 2020 Oct;34(10):2592-2606.
[5] Tayla B Heavican, Alyssa Bouska, Jiayu Yu, Waseem Lone, Catalina Amador, Qiang Gong, Weiwei Zhang, Yuping Li, Bhavana J Dave, Maarja-Liisa Nairism?gi, Timothy C Greiner, Julie Vose, Dennis D Weisenburger, Cynthia Lachel, Chao Wang, Kai Fu, Jadd M Stevens, Soon Thye Lim, Choon Kiat Ong, Randy D Gascoyne, Edoardo Missiaglia, Francois Lemonnier, Corinne Haioun, Sylvia Hartmann, Martin Bjerreg?rd Pedersen, Maria Antonella Laginestra, Ryan A Wilcox, Bin Tean Teh, Noriaki Yoshida, Koichi Ohshima, Masao Seto, Andreas Rosenwald, German Ott, Elias Campo, Lisa M Rimsza, Elaine S Jaffe, Rita M Braziel, Francesco d'Amore, Giorgio Inghirami, Francesco Bertoni, Laurence de Leval, Philippe Gaulard, Louis M Staudt, Timothy W McKeithan, Stefano Pileri, Wing C Chan, Javeed Iqbal. Genetic drivers of oncogenic pathways in molecular subgroups of peripheral T-cell lymphoma. Blood. 2019 Apr 11;133(15):1664-1676.
[6] Zhang XR, Chien PN, Nam SY, Heo CY.Anaplastic Large Cell Lymphoma: Molecular Pathogenesis and Treatment. Cancers (Basel). 2022 Mar 24;14(7):1650.
[7] Myunggon Ko 1, Hozefa S Bandukwala, Jungeun An, Edward D Lamperti, Elizabeth C Thompson, Ryan Hastie, Angeliki Tsangaratou, Klaus Rajewsky, Sergei B Koralov, Anjana Rao. Ten-Eleven-Translocation 2 (TET2) negatively regulates homeostasis and differentiation of hematopoietic stem cells in mice. Proc Natl Acad Sci U S A. 2011 Aug 30;108(35):14566-71.
[8] Odejide O, Weigert O, Lane AA, Toscano D, Lunning MA, Kopp N, Kim S, van Bodegom D, Bolla S, Schatz JH, Teruya-Feldstein J, Hochberg E, Louissaint A, Dorfman D, Stevenson K, Rodig SJ, Piccaluga PP, Jacobsen E, Pileri SA, Harris NL, Ferrero S, Inghirami G, Horwitz SM, Weinstock DM. A targeted mutational landscape of angioimmunoblastic T-cell l ymphoma. Blood. 2014 Feb 27;123(9):1293-6.
[9] Kubuki Y, Yamaji T, Hidaka T, Kameda T, Shide K, Sekine M, Kamiunten A, Akizuki K, Shimoda H, Tahira Y, Nakamura K, Abe H, Miike T, Iwakiri H, Tahara Y, Sueta M, Yamamoto S, Hasuike S, Nagata K, Kitanaka A, Shimoda K.TET2 mutation in diffuse large B-cell lymphoma. J Clin Exp Hematop. 2017;56(3):145-149.
[10] Yang L, Rodriguez B, Mayle A, Park HJ, Lin X, Luo M, Jeong M, Curry CV, Kim SB, Ruau D, Zhang X, Zhou T, Zhou M, Rebel VI, Challen GA, Gottgens B, Lee JS, Rau R, Li W, Goodell MA. DNMT3A loss drives enhancer hypomethylation in FLT3-ITD-associated leukemias. Cancer Cell. 2016 Jun 13;29(6):922-934.
[11] Liran I Shlush, Sasan Zandi, Amanda Mitchell, Weihsu Claire Chen, Joseph M Brandwein, Vikas Gupta, James A Kennedy, Aaron D Schimmer, Andre C Schuh, Karen W Yee, Jessica L McLeod, Monica Doedens, Jessie J F Medeiros, Rene Marke, Hyeoung Joon Kim, Kwon Lee, John D McPherson, Thomas J Hudson; HALT Pan-Leukemia Gene Panel Consortium; Andrew M K Brown, Fouad Yousif, Quang M Trinh, Lincoln D Stein, Mark D Minden, Jean C Y Wang, John E Dick. Identification of pre-leukaemic haematopoietic stem cells in acute leukaemia. Nature. 2014 Feb 20;506(7488):328-33.
[12] Staci L Haney, G Michael Upchurch, Jana Opavska, David Klinkebiel, Ryan A Hlady, Sohini Roy, Samikshan Dutta, Kaustubh Datta, Rene Opavsky. Dnmt3a is a haploinsufficient tumor suppressor in CD8+ peripheral T cell lymphoma. PLoS Genet. 2016 Sep 30;12(9):e1006334.
[13] Qiong Li, Chunhua Tang, Jie Zhu, Lili Zhang.A case of progressive multifocal leukoencephalopathy with hypogammaglobulinemia and a TCF3 mutation. J Neurovirol. 2022 Dec;28(4-6):616-618.
[14] Ae Kyung Park, Pora Kim, Leomar Y Ballester, Yoshua Esquenazi, Zhongming Zhao. Subtype-specific signaling pathways and genomic aberrations associated with prognosis of glioblastoma. Neuro Oncol. 2019, Jan 1;21(1):59-70.
[15] Timmins MA, Wagner SD, Ahearne MJ. The new biology of PTCL-NOS and AITL: current status and future clinical impact. Br J Haematol. 2020 Apr;189(1):54-66.
[16] Wang J, Tang W, Zhang W, Wang J, Chen F, Zhong L, Chen Y, Chen G. Clinicopathological characterization of follicular helper T-cell-derived peripheral T-cell lymphoma involving Waldeyer's ring. Virchows Arch. 2021 Aug 479(2):355-363.
[17] Fan J, Bellon M, Ju M, Zhao L, Wei M, Fu L, Nicot C. Clinical significance of FBXW7 loss of function in human cancers. Mol Cancer. 2022 Mar 26;21(1):87.
[18] Hu L, Zhang X, Li H, Lin S, Zang S. Targeting TET2 as a Therapeutic Approach for Angioimmunoblastic T Cell Lymphoma. Cancers (Basel). 2022 Nov 20;14(22):5699.
[19] Arisi MF, Dotan E, Fernandez SV. Circulating Tumor DNA in Precision Oncology and Its Applications in Colorectal Cancer. Int J Mol Sci. 2022 Apr 18;23(8):4441.
[20] Haiying Fu, Huarong Zhou, Yanyan Qiu, Jianfei Wang, Zhiming Ma, Hongping Li, Feng Zhang, Chenxi Qiu, Jianzhen Shen, Tingbo Liu. SEPT6_TRIM33 Gene Fusion and Mutated TP53 Pathway Associate With Unfavorable Prognosis in Patients With B-Cell Lymphomas. Front Oncol. 2021 Dec 1,11: 765544.
[21] Soerensen JF, Aggerholm A, Rosenberg CA, Bill M, Kerndrup GB, Ebbesen LH, Hansen MH, Roug AS, Ludvigsen M. Clonal evolution in patients developing therapy-related myeloid neoplasms following autologous stem cell transplantation. Bone Marrow Transplant. 2022 Mar;57(3):460-465.
