我校與合作者在肝細(xì)胞癌標(biāo)志物及治療靶點(diǎn)方面取得進(jìn)展
肝細(xì)胞癌(HCC)的早期診斷和靶向治療是提高HCC患者治愈率和生存率的主要途徑。研究發(fā)現(xiàn)CircRNAs或是一種頗具潛力的腫瘤診斷生物標(biāo)記物和治療靶標(biāo)。2019.2.4山西醫(yī)科大學(xué)2016級(jí)微生物專業(yè)碩士研究生雷波等在CancerMedicine發(fā)表題為Circular RNA expression profiles of peripheral blood mononuclear cells in hepatocellular carcinoma patients by sequence analysis的研究論文。論文通過RNA-seq揭示了一種circRNA(circ_0000798)可作為HCC早期篩查標(biāo)志物和治療的新靶點(diǎn)。該文由山西醫(yī)科大學(xué)與陸軍軍醫(yī)大學(xué)合作完成,山西醫(yī)科大學(xué)為第一產(chǎn)權(quán)單位。
本研究首先通過高通量RNA-seq技術(shù),深度分析HCC特異差異表達(dá)的候選RNA分子,經(jīng)擴(kuò)大樣本RT-PCR驗(yàn)證篩選出HCC特異高表達(dá)的circ_0000798。經(jīng)Sanger測(cè)序驗(yàn)證及統(tǒng)計(jì)分析證明circ_0000798與HCC肝硬化,腫瘤大小等顯著正相關(guān),與患者生存時(shí)間顯著負(fù)相關(guān),ROC曲線表明該分子可作為HCC早期診斷的標(biāo)記物(相關(guān)成果已申請(qǐng)發(fā)明專利,實(shí)質(zhì)審查階段)。
此外,該研究經(jīng)生物信息學(xué)多維度分析表明circ_0000798可海綿多個(gè)HCC特異的miRNA分子,調(diào)控免疫效應(yīng)分子IFNG,TNFAIP和ICAM1以及免疫調(diào)節(jié)分子FOS,BCL家族和SGK1等,解讀了circ_0000798對(duì)HCC病理的免疫調(diào)控作用,為后續(xù)靶向circ_0000798治療HCC奠定了基礎(chǔ)。
RNA-seq展示差異火山圖和熱圖
qRT-PCR及Sanger測(cè)序驗(yàn)證結(jié)果
預(yù)后及ROC曲線展示