基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)學(xué)科是山西省唯一的基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)博士學(xué)位授權(quán)點，擁有省內(nèi)最優(yōu)秀的基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)科研團(tuán)隊，長期以來一直開展基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)理論和應(yīng)用研究，圍繞食管癌發(fā)生機(jī)理、心肌缺血性疾病、肝臟纖維化、糖尿病、心腦血管病藥物、干細(xì)胞等方向開展研究。目前形成了人體生理與病理生理學(xué)、再生醫(yī)學(xué)、病理學(xué)、人體解剖與組織胚胎學(xué)、基礎(chǔ)藥理與分子藥理學(xué)、醫(yī)學(xué)信息學(xué)等六個穩(wěn)定的研究方向。

2016年以來學(xué)科主持國家級科研項目48項、省部級科研項目51項，發(fā)表SCI論文130篇，專利？項，獲得省部級科研成果獎7項。公開發(fā)表的學(xué)術(shù)論文中，圍繞神經(jīng)退行性疾病藥物治療的機(jī)制研究、代謝紊亂相關(guān)心血管疾病的多種機(jī)制研究、心肌再生的基礎(chǔ)與臨床研究、食管鱗癌遺傳變異的分析鑒定及癌變機(jī)制研究、健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)應(yīng)用及精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)等研究領(lǐng)域，形成了多篇標(biāo)志性學(xué)術(shù)成果。其中以國家百千萬工程人選、教育部“新世紀(jì)優(yōu)秀人才”、山西省青年三晉學(xué)者、“三晉英才”高端領(lǐng)軍人才崔永萍教授帶領(lǐng)的團(tuán)隊，依托“食管癌發(fā)病機(jī)理及轉(zhuǎn)化研究”山西省重點實驗室和山西省科技創(chuàng)新重點團(tuán)隊，圍繞我國特色、山西高發(fā)的食管鱗癌，聚焦于食管鱗癌早篩、早診標(biāo)記物和食管癌驅(qū)動基因作用網(wǎng)絡(luò)研究方向，利用多組學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)和分子生物學(xué)技術(shù)與手段，在食管癌發(fā)生發(fā)展中關(guān)鍵基因的作用及其功能研究基礎(chǔ)上，取得了系列原創(chuàng)成果。據(jù)Web of Science數(shù)據(jù)，近五年在全球食管癌遺傳變異分析領(lǐng)域最有影響力的人員中，本學(xué)科貢獻(xiàn)達(dá)17%，排名第5。

學(xué)科于2016年獲批國家級實驗教學(xué)示范中心，成為區(qū)域一流的基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)教學(xué)和研究平臺。另外為了滿足科研需求，于2019年底在中都校區(qū)建成占地8000平米的基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究中心為學(xué)科的未來發(fā)展提供了有力支撐。