基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)是山西醫(yī)科大學(xué)最早、最重要的一級學(xué)科，二級學(xué)科1978年起招收碩士研究生，生理學(xué)科1986年起招收博士研究生，2006年獲批一級學(xué)科碩士學(xué)位授權(quán)點，2018年獲批一級學(xué)科博士授權(quán)點。

學(xué)科是山西省最優(yōu)秀的一級學(xué)科之一，獲得山西省1331工程”優(yōu)勢特色學(xué)科建設(shè)項目資助。學(xué)科下設(shè)生理學(xué)國家重點學(xué)科、細胞生理學(xué)教育部重點實驗室，細胞生理學(xué)、出生缺陷與細胞再生、實驗動物與人類疾病動物模型 等5個山西省重點實驗室，山西省新藥工程技術(shù)研究中心和山西省研究生教育創(chuàng)新中心，2016年獲批國家級實驗教學(xué)示范中心。學(xué)科擁有優(yōu)秀的導(dǎo)師隊伍，建有8000平米的基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究中心，擁有較完備、先進的實驗室設(shè)備和技術(shù)平臺，是區(qū)域一流的基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)教學(xué)和研究平臺，是山西省醫(yī)學(xué)研究成果產(chǎn)出基地和高級專業(yè)人才培養(yǎng)的搖籃，為山西省醫(yī)學(xué)決策和衛(wèi)生健康提供有力支持。

學(xué)科設(shè)有六個學(xué)科方向，即人體生理與病理生理學(xué)、再生醫(yī)學(xué)、病理學(xué)、人體解剖與組織胚胎學(xué)、基礎(chǔ)藥理與分子藥理學(xué)、醫(yī)學(xué)信息學(xué)。學(xué)科科研聚焦臨床問題，圍繞我省高發(fā)病凝練研究內(nèi)容，在阿爾茨海默病、疼痛及其調(diào)制、心血管受體自身免疫、心肌電生理與心律失常、糖尿病、神經(jīng)管畸形、食管癌的發(fā)生機制與防治等領(lǐng)域都有領(lǐng)先成果，在國內(nèi)外有一定影響力。

學(xué)科2019年起招收基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)五年制本科學(xué)生，構(gòu)建了本科、碩士、博士貫通式培養(yǎng)體系。學(xué)科致力于培養(yǎng)具備堅定理想信念和良好道德品質(zhì)，具有全面綜合素質(zhì)、扎實基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)基本理論和實驗技能，富有創(chuàng)新精神和實踐能力、有較大發(fā)展?jié)撃?，能在高等醫(yī)學(xué)院校從事教學(xué)與科研，能在醫(yī)藥衛(wèi)生領(lǐng)域從事基礎(chǔ)研究與應(yīng)用開發(fā)的不同層次專業(yè)人才，培養(yǎng)優(yōu)秀的社會主義事業(yè)的建設(shè)者和接班人。學(xué)科研究生生源質(zhì)量較好，以國內(nèi)醫(yī)學(xué)和生物學(xué)背景的本科生為主。

學(xué)科歷史悠久，聲名卓著，在省內(nèi)有著舉足輕重的位置，在國際國內(nèi)占有一席之地。學(xué)科是中國高等教育學(xué)會基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)分會成立首倡者之一，創(chuàng)辦了首個基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)教學(xué)研究類期刊《基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)教育》。學(xué)科擁有喬健天、趙榮瑞、韓德五、曹濟民、解軍教授等一批國內(nèi)非常有影響力的科學(xué)家。四十多年來培養(yǎng)博碩士近2000名，遍布國內(nèi)外，蘇州大學(xué)熊思東校長、中國工程院徐建國院士、田志剛院士等是其中的杰出代表。學(xué)科科研成果突出，學(xué)術(shù)交流活躍，成功舉辦了亞太IBRO腦科學(xué)培訓(xùn)班等國際國內(nèi)學(xué)術(shù)會議，擴大了學(xué)術(shù)影響力。

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